| 000 | 00978camcc2200325 c 4500 | |
| 001 | 000000791090 | |
| 005 | 20110420180547 | |
| 007 | ta | |
| 008 | 020503s2002 ulk 001c kor | |
| 020 | ▼a 8979141807 ▼g 13560 | |
| 035 | ▼a KRIC08154027 | |
| 040 | ▼a 241026 ▼c 241026 ▼d 211009 | |
| 041 | 1 | ▼a kor ▼h eng |
| 049 | 0 | ▼l 121066152 ▼l 121066153 |
| 082 | 0 4 | ▼a 005.133 ▼2 22 |
| 085 | ▼a 005.133 ▼2 DDCK | |
| 090 | ▼a 005.133 ▼b P451 2002 | |
| 100 | 1 | ▼a Tisdall, James D. |
| 245 | 1 0 | ▼a 펄로 시작하는 바이오 인포매틱스 / ▼d 제임스 티스달 지음 ; ▼e 박현석 역 |
| 246 | 1 9 | ▼a Beginning perl for bioinformatics |
| 260 | ▼a 서울 : ▼b 한빛미디어, ▼c 2002 | |
| 300 | ▼a 509 p. ; ▼c 26 cm | |
| 500 | ▼a 생물학자를 위한 펄 프로그래밍 입문서 | |
| 500 | ▼a 부록: 리소스, 펄 요약 | |
| 500 | ▼a 색인수록 | |
| 650 | 0 | ▼a Perl (Computer program language) |
| 650 | 0 | ▼a Bioinformatics |
| 700 | 1 | ▼a 박현석, ▼e 역 |
| 900 | 1 0 | ▼a 티스달, 제임스, ▼e 저 |
소장정보
| No. | 소장처 | 청구기호 | 등록번호 | 도서상태 | 반납예정일 | 예약 | 서비스 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No. 1 | 소장처 과학도서관/Sci-Info(1층서고)/ | 청구기호 005.133 P451 2002 | 등록번호 121066153 (24회 대출) | 도서상태 대출가능 | 반납예정일 | 예약 | 서비스 |
| No. 2 | 소장처 과학도서관/보존서고5(동양서)/ | 청구기호 005.133 P451 2002 | 등록번호 121066152 (19회 대출) | 도서상태 대출가능 | 반납예정일 | 예약 | 서비스 |
컨텐츠정보
책소개
과제 해결을 통해 프로그래밍을 스스로 익히도록 구성된 바이오인포매틱스 입문서. 이 책은 펄을 이용해 프로그래밍을 해본 적이 없는 생물학자가 펄을 사용해서 생물학 데이터를 처리할 수 있는 프로그램을 스스로 만들 수 있도록 하는 데 목적이 있다.
각 장은 특정 문제나 클래스 문제 해결에 중점을 두어 설명하며 프로그램을 조금씩 확장 수정해가며 완전한 프로그램으로 만들어간다. 각 장의 마지막에는 연습문제를 두어 실제로 특정 과제를 해결할 수 있는 프로그램을 작성해 볼 수 있도록 했다.
펄은 생물학 자료 분석을 위한 가장 이상적인 언어이다. 이 책을 읽은 후 독자들은 펄에 대한 기본 지식뿐만 아니라 BLAST와 GenBank를 파싱하는 작업을 위한 프로그램 모음, 고급 수준의 생명정보학 프로그램을 다루는 기술 모두를 이해할 수 있다.
주요 내용은 아래와 같다.
- 프로그래밍 기초와 DNA 서열 및 문자열 작업
- 코드 디버깅
- 임의수 생성기를 이용한 유전자 변이 모의 실험
- 정규 표현식과 모티프 탐색
- 배열, 해시, 관계형 데이터베이스
- 정규 표현식과 제한 지도
- 펄을 사용한 PDB 레코드, GenBank 주석, BLAST 출력 파싱
정보제공 :
저자소개
제임스 티스달(지은이)
바이오인포매틱스 소프트웨어를 개발하고 교육하는 킴버튼 바이오컴퓨팅 어소시에이츠(Biocomputing Associates of Kimberton)에서 컨설팅을 하고 있다. 머레이 힐에 있는 벨 연구소에서 일했으며, 뉴저지의 스피치 리서치 디파트먼트(Speech Research Department)에서 프로그래밍을 하기도 했다. 벨 연구소에 있을 당시 음악 리듬을 분석하는 일반 언어를 개발한 바 있으며, 구조 복합 이론을 발표했다. 그는 뉴욕 주립 대학교에서 수학 학사 학위를 취득했으며 콜롬비아 대학교에서 컴퓨터 공학 석사, 미시건 대학교와 펜실베니아 대학교에서 컴퓨터 공학 박사 학위을 취득했다.
박현석(옮긴이)
캠브리지대학교 전산학 박사이며, 동경대학교 정보과학과 조수, (주)마크로젠 대표이사, 이화여자대학교 교육대학원 소프트웨어교육전공 주임 등을 거쳐, 현재 이화여자대학교 인공지능대학 학장을 역임하고 있다.
목차
목차 추천사 = 6 역자 서문 = 8 차례 = 10 서문 = 15 1장. 생물학과 전산학 DNA의 구조 = 26 단백질의 구조 = 28 인 실리코 = 29 컴퓨터 사용의 한계 = 31 2장. 펄 시작하기 쉽지만 오래 공부해야 할 언어 = 34 펄의 장점 = 36 펄 설치 = 39 펄 프로그램 실행 방법 = 44 문서 편집기 = 46 도움말 찾기 = 47 3장. 프로그래밍 기술 프로그래밍, 무엇부터 시작할까 = 52 편집, 실행, 수정, 저장 = 52 프로그래밍 환경 = 55 프로그래밍 전략 = 56 프로그래밍 과정 = 59 4장. 서열과 문자열 서열 데이터의 표현 = 68 DNA 서열 저장을 위한 프로그램 = 71 DNA 조각 연결 = 77 전사 : DNA를 RNA로 = 81 펄 문서의 사용 = 85 펄의 역상보 계산 = 86 단백질, 파일, 배열 = 91 파일에서의 단백질 해석 = 91 배역 = 96 스칼라 문맥과 리스트 문맥 = 100 연습문제 = 102 5장. 모티프와 루프 제어 흐름 = 106 코드 배치 = 114 모티프 탐색 = 116 뉴클리오타이드 개수 세기 = 124 문자열을 배열로 분해하기 = 126 문자열에서의 연산 = 134 파일에 쓰기 = 140 연습문제 = 144 6장. 서브루틴과 버그 서브루틴 = 147 스코핑과 서브루틴 = 152 명령어 라인 인자와 배열 = 159 데이터를 서브루틴으로 보내기 = 163 서브루틴 모듈과 라이브러리 = 168 코드의 버그 수정 = 170 연습문제 = 187 7장. 변이와 임의화 임의수 생성기 = 190 임의화를 사용한 프로그램 = 192 DNA 변이 모의실험 프로그램 = 200 임의의 DNA 생성하기 = 213 DNA 분석 = 220 연습문제 = 227 8장. 유전자 코드 해시 = 231 생물학을 위한 데이터 구조와 알고리즘 = 233 유전자 코드 = 240 DNA를 단백질로 번역하기 = 250 FASTA 포맷 파일에서 DNA 데이터 읽기 = 255 리딩 프레임 = 266 연습문제 = 273 9장. 제한 지도와 정규 표현식 정규 표현식 = 287 제한 지도와 제한 효소 = 280 펄 연산자 = 297 연습문제 = 298 10장. GenBank GenBank 파일 = 303 GenBank 라이브러리 = 307 서열과 주석 분리하기 = 309 주석 파싱하기 = 319 DBM을 이용한 GenBank 인덱싱 = 345 연습문제 = 352 11장. 단백질 데이터 뱅크 PDB 개요 = 356 파일과 폴더 = 358 PDB 파일 = 369 PDB 파일 파싱 = 379 다른 프로그램 제어 = 391 연습문제 = 398 12장. BLAST BLAST 구하기 = 402 문자열 매칭과 상동성 = 403 BLAST 출력 파일 = 405 BLAST 출력 파싱 = 410 데이터 표현 = 422 바이오펄 = 428 연습문제 = 436 13장. 그밖의 논제 프로그램 디자인 기술 = 439 웹 프로그래밍 = 440 알고리즘과 서열 정렬 = 441 객체 지향 프로그래밍 = 441 펄 모듈 = 441 복합 데이터 구조 = 442 관계형 데이터베이스 = 442 마이크로어레이와 XML = 443 그래픽 프로그래밍 = 444 네트워크 모델링 = 444 DNA 컴퓨터 = 445 부록 A. 리소스 = 447 부록 B. 펄 요약 = 459 찾아보기 = 504